مناقشة رسالة طالبة الماجستير زمن عطية صباح من قسم علوم الحياة

ناقش قسم علوم الحياة في كلية العلوم بجامعة ديالى رسالة طالبة الماجستير زمن عطية صباح والموسومة دراسة جزيئية لبكتريا Escherichia coli المعزولة من أخماج مختلفة والتحري عن عاثياتها البكتيرية وذلك يوم الثلاثاء الموافق 2018/1/16 وعلى قاعة المناقشات في عمادة الكلية .

تضمنت الدراسة جمع 250 عينة ادرار من الاطفال المقيمين في مخيم معسكر سعد للنازحين المشكوك باصابتهم بالتهاب المسالك البولية الذين اعمارهم دون (12) سنة ومن كلا الجنسين حيث تم اجراء الاختبارات الكيميائية والفيزيائية على عينات الادرار فأظهرت النتائج ان نسبة الحامضية والقاعدية للعينات كانت 94.8% و5.2% على التوالي , ونسبة وجودAlbumin 12.8% والعكورة 26.8% والكثافة النوعية الاعلى من 1025كانت بنسبة 20% , كذلك تم اجراء فحص مجهري للعينات حيث اظهرت النتائج وجود pus cell,RBC ,Ca ,Uric acid ,Bacteria بنسبة 28%,40%,16%,21.6%,16%.

وقد تم الحصول على15 (30%)عزلة من بكتريا E. coli , توزعت العينات بنسبة 60% للاناث و40% للذكور بعد اجراء التشخيص البكتيري المعتمد على المواصفات المجهرية والزرعية والفحوصات الكيموحيوية , وتمَّ تأكيد التشخيص بإستخدام نظام API 20 E وجهاز VITEK 2, إضافة الى إجراء التشخيص الجزيئي بالكشف عن وجود الجين 16s rRNA في العزلات بإستخدام PCR . وقد كشف التشخيص الجزيئي للعزلات أنها حاملة للجين 16S rRNA وبنسبة %100 .

وتضمنت الدراسة اجراء اختبار حساسية عزلات بكتريا E.coli للمضادات الحيوية بأستخدام جهاز VITEK 2 اتجاه 18 مضاد حيوي مختلف وشملت المضادات الحيوية الاتية : Ampicillin , Augmentin, Pipracillin,Cefuroxime , Cefuroxime Axetil, Cefoxitin, Cefixime, ceftazidime, Ceftriaxone, Ertapenem, Impenem ,Meropenem, Amikacin, gentamycin,Ciprofloxacin, Fosfomycin, Nitrofourantoin, Trimethoprim و بلغت نسبة المقاومة للمضادات93.3%,40%,20%80%,93.3%,26.7%,80%,80%,100% ,0%,0%,0%,0%,46.7%,20%,20%,6.7%,73.3% على التوالي.

حيث تراوحت قيم المتوسط الحسابي للتركيز المثبط الأدنى MIC لمضادات المذكورة 34.13 و14.80 و25.87 و44.00 و56.00 و13.33 و 33.87و 4.00 و52.28 و0.19 و0.25 و0.40 و6.13 و6.13 و0.77 و 38.40و38.40 و180 مايكروغرام/مول على التوالي .

كما تضمنت الدراسة الكشف عن إنتاج العزلات البكتيرية لعوامل الضراوة حيث أظهرت جميع العزلات قدرتها على الالتصاق على الخلايا الطلائية للقناة البولية بنسبة 100% ، وقدرتها على تكوين Colicin بنسبة 60% ,كما أظهرت جميع العزلات قدرتها على انتاج الغشاء الحياتي Biofilm وبنسبة 100% .

وأجري التحري عن جينات fim H,col E1,pap لجميع عزلات E.coli باستعمال بوادئ نوعية لهذه الجينات وذلك باستخلاص DNA البكتيري ومن ثم اخضاع DNA لأختبار البلمرة التضاعفي التسلسليPCR واظهرت النتائج وجود الجينات fimH ,pap في جميع العزلات بنسبة 100% اما الجين col E1 فقد وجد في 9 عزلات وبنسبة 60% .

وأظهرت ننتائج تسلسل القواعد الانتروجينية لنواتج تقنية PCR وجود 44 طفرة في 5 عينات من الجين 16S rRNA ووجود أكثر من طفرة في كل عينة , وبنسبة تطابق تراوحت بين 93%-99%, فقد قمنا بتسجيل تتابع العينات المرقمه (2,8) التي خضعت للتوصيف الجزيئي التأكيدي في قاعدة البيانات في المركز الوطنيNCBI الخاص ببنك الجينات وتم الحصول على الارقام التسلسلية Accession Numbers Lc278375 وLc278376 للعزلات المسجلة .

وتضمنت الدراسة أيضاً اختبار العاثي Bacteriophages من مياه الصرف الصحي العائده لمستشفى بعقوبه العام بطريقة plaque على15 عزلة من بكتريا E.coli معزولة من اطفال مصابين بالتهاب المجاري البولية , اظهرت النتائج ان %60 من العزلات كانت حساسة واصيبت بالعاثي وتمت معايرة العاثي بطريقة حساب عدد plaques الظاهرة بطريقه ثنائي الطبقه بينت النتائج ان افضل تخفيف كان 10-4 حيث كان عدد plaque (260) .

كما قدمت هذه الدراسة خصوصية وحساسية عالية لتشخيص البكتريا E.coli إلى جانب إنخفاض التكلفة وسرعة اسلوب تقنية PCRعلى الطرق التقليدية المستخدمة حاليا في المستشفيات والمختبرات التي تستغرق وقتا طويلا .

وتألفت لجنة المناقشة من السادة المدرجة أسماؤهم في أدناه :

الأستاذ الدكتور فرج محمد المرجاني / كلية العلوم / الجامعة المستنصرية … رئيساً
الأستاذ المساعد الدكتور أحمد عبد الجبار سلمان / كلية العلوم / جامعة الأنبار … عضواً
المدرس الدكتورة زهراء جعفر جميل / كلية العلوم / جامعة ديالى … عضواً
الأستاذ الدكتور هادي رحمن رشيد / كلية العلوم / جامعة ديالى … عضواً ومشرفاً

وقد تم قبول الرسالة وحصلت الطالبة على درجة الماجستير في تخصص الأحياء المجهرية .

<< الموضوع التالي | الموضوع السابق >>