مناقشة رسالة طالب الماجستير عمر أياد أنصيف من قسم علوم الحاسوب

ناقش قسم علوم الحاسوب في كلية العلوم بجامعة ديالى رسالة طالب الماجستير عمر أياد أنصينف الموسومة تحسين اليرعات مقابل الخوارزمية الجينية الهجينة لاستنتاج شجرة النشوء والتطور وذلك على قاعة المناقشات في عمادة الكلية.

أوضح الباحث في دراسته أن الغرض من أبحاث تحليل النشوء والتطور هو دراسة التعديلات التي تحدث في الأنواع المختلفة خلال عملية التطور وإيجاد الروابط بين تسلسل الحمض النووي الجيني واكتشاف تسلسل الأسلاف وتسلسل أحفادهم. يمكن أيضًا استخدام تحليل علم الوراثة لتقدير فترة الاختلاف بين مجموعات الأنواع التي يمكن إرجاعها إلى نفس السلف. في تخصصات مثل المعلوماتية الحيوية ، تعتبر أشجار النشوء والتطور مهمة لتحليل ومقارنه النسج نسبي .

تُستخدم البيانات الجزيئية مثل تسلسل الحمض النووي والبروتين لبناء أشجار النشوء والتطور. العقد ، أو الوحدات التصنيفية ، في شجرة النشوء والتطور تمثل التسلسلات الجينومية. ترتبط أي عقدتين متجاورتين من قبل كل فرع. على الفروع الخارجية ، أي تسلسل مشابه سيكون له جار ، وسيقوم فرع داخلي مشترك بربطهم بسلف مشترك. تشير الوحدات التصنيفية الافتراضية إلى التفرع الداخلي. نتيجة لذلك ، يُعتقد أن جميع الوحدات التصنيفية في الشجرة قد انحدرت من سلف مشترك.

اقترح في هذه الرسالة نظامًا لبناء أشجار النشوء والتطور بشكل أسرع وقوة لإيجاد الحلول المثلى بناءً على خوارزمية . firefly optimization يتكون النظام المقترح من أربع مراحل رئيسية: – تحميل مجموعة بيانات DNA لتسع عائلات نباتية التي تنتمي الى نوع Apiales ، وتقييم جميع الجينات في مجموعة البيانات باستخدام خوارزمية Boyer Moore ، وخوارزمية Firefly Optimization لاختيار أفضل جينوم مطابق لكل عائلة نباتية ، وبناء (UPGM) ، وتقييم الأداء باستخدام قياسات bootstrap وأخيراً إجراء المقارنة بين الخوارزمية الجينية وخوارزمية firefly optimization.

أظهر تنفيذ ونتائج كل مرحلة في النظام المقترح أن النظام المقترح لديه القدرة على البناء السريع لشجرة النشوء باستخدام خوارزمية firefly optimization وتقييم أداء النظام المقترح بناءً على مقياس bootstrap الذي يقيس مدى التطابق بين أشجار العائلة وأن أفضل قيمة تحصل عليها في النظام المقترح = 0.919013 .

وتألفت لجنة المناقشة من السادة المدرجة أسماؤهم أدناه:

أ. د. ظاهر عبد الهادي عبد الله / جامعة ديالى / كلية العلوم .. رئيساً
أ. م. د. أحمد صباح أحمد / جامعة تكنولوجيا المعلومات والاتصالات / كلية المعلوماتية الطبية الحيوية .. عضواً
أ. م. د. حسن هادي صالح / جامعة ديالى / كلية التربية البدنية وعلوم الرياضة .. عضواً
أ.. د. طه محمد حسن / جامعة ديالى / كلية العلوم .. عضواً ومشرفاً
أ. م. د. بشار طالب حميد / جامعة ديالى / كلية العلوم .. عضواً ومشرفاً

وقد تم قبول الرسالة ومنح الطالب درجة الماجستير في تخصص علوم الحاسوب .. ألف مبارك ..